Для включения в реестр организация направляет в уполномоченный орган государственной власти субъекта Российской Федерации составленное в произвольной форме заявление о включении в реестр с приложением документов, которые описаны в этой статье https://nalogcodex.ru/nk1/Razdel-II/Glava-3.3/Statya-25.11/